三中全會公報提出「確保依法獨立公正行使審判權檢察權」，
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，大陸法界專家指出，
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，這是自1987年中共13大報告提出「保障司法機關依法獨立行使職權」以來，
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，大陸首度將這帶有「司法獨立」意義的內容，
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，寫入中全會公報。
行政干預司法，
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，一直是大陸司法獨立主要障礙。人民大學教授陳衛東表示，
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，司法地方化、行政化，
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，是法院、檢察院受地方行政干預的主要癥結。分析人士指出，
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，兩院（司法、檢察）組織法目前已被人大常委會列入修改計畫。
據指出，
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，改革路徑是使兩院財政權、人事權不再依附地方，由上一級人大及常委會決定人事任命，由上一級財政保證下級兩院運行。此前，中共在18大降低「政法委員會」層級，也是此一方向努力之一。
這是一年來中共官方第三次對外強調保障司法職權獨立。18大前夕，中共發布首部司法改革白皮書，將保障兩院獨立行使職權列為「中國司法改革的根本目標」。三中全會前夕，大陸最高法相關負責人公開表示，加強審判獨立將成為三中全會之後司法改革的方向。
此外，公報還指出，要「完善人權司法保障制度」，分析家指出，眾所詬病的勞教制度極可能將被正式廢除。，