南聯內戰始自1991年，
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，歷時8年，
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，之後聯邦瓦解。聯邦6個加盟共和國有4國（包括克羅埃西亞）在初期相繼宣告獨立，
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，塞爾維亞人（塞族）掌控的南聯部隊遂與各國塞族聯手，
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，掀起族裔血腥衝突。克國獨立戰爭則發生於1991至1995年，
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，近2萬人喪生，泰半是克羅埃西亞人（克族）。1991年，南聯陸軍與克境塞族占領伏科瓦市（Vukovar）3個月，毀城並驅逐克族，數萬平民流離失所，另260名男子被殺。4年後，克國軍方為奪回失土，轟炸克境塞族聚居地克拉吉納（Krajina），迫使20萬塞人出亡。1999年，克國向國際刑事法院控告以塞國總統米羅塞維奇為首的塞族當年荼毒克族，肆行「種族清洗」，違反聯合國《防止及懲治滅絕種族罪公約》。翌年，塞國反控克國在1995年驅逐克拉吉納20萬塞人，同樣違反公約。，