二代健保上路半個月，
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，補充保費爭議仍未平息，
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，各大學每年要繳交數百萬到數千萬元的雇主補充保費，
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，學校大喊吃不消。健保局表示，
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，大學是投保單位也是雇主，
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，補充保費上路，
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，依法規定，
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，雇主即須繳交二％的補充保費。
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，除一般保費，個人只要有執行業務收入、兼職所得、股利所得、利息所得及租金收入等五項收入，單筆逾五千元將收取一筆二％的補充保費。雇主也必須繳交補充保費，健保局承保組長洪清榮指出，凡是扣繳憑單上所得稅碼代號「五○」，大學就須扣繳一筆二％的雇主補充保費。
他舉例，學校的考績獎金、教學特優教師獎助金、研究計畫主持人研究費、出席費、諮詢費、鐘點費、顧問費、子女教育或結婚等補助費，只要所得類別屬於「五○」，大學即須以雇主身分繳交補充保費。
有大學校長指出，教授向國科會或教育部等單位承接計畫案，卻要由大學支付雇主補充保費，實在很不合理。
衛生署健保小組副召集人曲同光回應，不論是國科會或教育部申請的研究案，都是由大學執行，相關經費也由學校開立扣繳憑單，學校身為投保單位、也是扣費義務人，所以應繳雇主二％的補充保費。，